Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCAPQ12770 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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