Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
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NUP160Q12769 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
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NUP160Q12769 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NUP160Q12769 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUP160Q12769 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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