Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ACSM1Q08AH1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ACSM1Q08AH1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms