Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LTBQ06643 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LTBQ06643 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LTBQ06643 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms