Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC9Q06265 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms