Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SRSF11Q05519 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SRSF11Q05519 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms