Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GBE1Q04446 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms