Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
OC90Q02509 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OC90Q02509 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms