Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
DSG1Q02413 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DSG1Q02413 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms