Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHDQ02161 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHDQ02161 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHDQ02161 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHDQ02161 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHDQ02161 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHDQ02161 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHDQ02161 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHDQ02161 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms