Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC10Q01780 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC10Q01780 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms