Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CDK6Q00534 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms