Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms