Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIM1P81133 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SIM1P81133 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms