Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACTG1P63261 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACTG1P63261 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms