Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBA52P62987 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBA52P62987 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBA52P62987 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
UBA52P62987 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBA52P62987 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms