Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HERVK_113P61574 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms