Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MTCP1P56278 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms