Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BLMP54132 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BLMP54132 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BLMP54132 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BLMP54132 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLMP54132 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLMP54132 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BLMP54132 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms