Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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