Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RORCP51449 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RORCP51449 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RORCP51449 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms