Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FNTBP49356 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms