Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNBP48739 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNBP48739 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms