Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CSNK1A1P48729 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms