Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CDKN1BP46527 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms