Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATRXP46100 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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