Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASP3P42574 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms