Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PIK3CBP42338 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms