Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTR1BP42025 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms