Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP7BP35670 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP7BP35670 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms