Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
OTX2P32243 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms