Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOBEC3AP31941 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms