Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPS1P31327 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPS1P31327 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPS1P31327 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPS1P31327 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPS1P31327 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPS1P31327 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPS1P31327 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPS1P31327 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms