Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HOXC13P31276 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HOXC13P31276 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms