Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA7P31268 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms