Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP1P29466 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP1P29466 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CASP1P29466 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CASP1P29466 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP1P29466 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms