Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX2P28328 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX2P28328 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX2P28328 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PEX2P28328 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PEX2P28328 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms