Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PSMB9P28065 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms