Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMLP26374 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMLP26374 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CHMLP26374 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMLP26374 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMLP26374 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms