Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms