Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGAM1P18669 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGAM1P18669 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms