Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPRAP18433 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPRAP18433 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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