Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXB4P17483 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms