Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZKSCAN1P17029 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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