Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL2P13500 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms