Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VPREB1P12018 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms