Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSB-PGBD3P0DP91 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms