Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TRAPPC2BP0DI82 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms