Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ACAA1P09110 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms