Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRCP08575 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PTPRCP08575 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PTPRCP08575 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PTPRCP08575 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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PTPRCP08575 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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PTPRCP08575 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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PTPRCP08575 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRCP08575 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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